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A cidade foi fundada por volta de 1877, por famílias italianas vindas de Gênova. No Espírito Santo, colonizaram uma área na cabeceira do rio Piraqueaçu, pelo qual chegaram à região. A área asentada, então conhecida como Núcleo Colonial Santa Cruz, já que Santa Cruz era então a localidade mais accesível, por estar à boca do rio Piraqueaçu. A sede desta área primeiro foi conhecida como Conde D'Eu.
O lugarejo teve vários nomes como Bocaiúva (após a proclamação da república), Vila Guaraná (ao tornar-se município), Pau Gigante em 1892 (devido a uma grande árvore na região), somente em 1942 é que a cidade, junto com o município ganharam nome de Ibiraçu. Mais recentemente em 1989 o municício de João Neiva separou-se de Ibiraçu.